سن خداحافظی در فوتبال آلمان پایین آمده است. پس از آندره شورله که در سن ۲۹ سالگی و بندیکت هوودس که در ۳۲ سالگی از فوتبال خداحافظی کردند، حالا ساندرو واگنر نیز در سن ۳۲ سالگی تصمیم گرفت برای همیشه با فوتبال وداع کند.

او پس از خداحافظی از فوتبال گفت: واقعا از این ماجراجویی طولانی لذت بردم و می‌خواهم از مربیان و هم تیمی‌هایم تشکر کنم. از همه طرفداران هم ممنونم. ما بهترین ورزشگاه‌ها و بهترین هواداران جهان در آلمان را داریم. من بسیار از فوتبال سپاسگزارم که زندگی فوق العاده‌ای به من بخشید. من توانستم به همه اهداف و آرزوهایم برسم و خصوصا با پوشیدن پیراهن تیم ملی به خودم افتخار کنم. در ماه سپتامبر، دوره مربیگری ام را با یک دوره ویژه زیر نظر فدراسیون فوتبال آلمان شروع می‌کنم. برنامه من این است که تابستان آینده مربیگری را آغاز کنم. حالا می‌خواهم یک سال مرخصی باشم و از حضور کنار خانواده ام لذت می‌برم.