محمد محبی در زمان اسکوچیچ به تیم ملی دعوت می‌شد، ولی فرصت کمی برای بازی کردن داشت.او به همین دلیل تصمیم گرفت به ایران بازگردد تا توانایی‌های فنی اش را به سرمربی وقت تیم ملی ثابت کند و فرصت بیشتری برای بازی کردن در ترکیب تیم ملی داشته باشد.

او بعد از امضای قرارداد با استقلال تاکید کرد برای حضور در جام جهانی و بازی کردن در ترکیب تیم ملی به ایران بازگشته است. اما در نهایت نتوانست نظر مثبت کی‌روش را جلب کند و از لیست مسافران اتریش برای دو بازی دوستانه با اروگوئه و سنگال خط خورد.در حالیکه گفته می‌شد سرمربی جدید تیم ملی از محبی رضایت دارد ولی او به خاطر مصدومیت جزئی تنها یک جلسه با تیم تمرین داشت و بیشتر به صورت اختصاصی کار کرد تا در نهایت مسافر اتریش نشود.

او حالا شانس کمی برای سفر به قطر و همراهی با تیم ملی را دارد و اگر می‌خواهد آرزوی بزرگی که خودش از آن سخن گفته بود،برآورده شود باید آنقدر در ادامه لیگ عالی کار کند تا کی‌روش نتواند روی نامش خط قرمز بکشد!