گفته می‌شد محمد دانشگر یکی از بازیکنانی است که در لیست خرید استقلال قرار دارد. البته باشگاه استقلال روی یکی دو بازیکن تیم سپاهان از جمله فرشاد احمدزاده هم دست گذاشته است اما پاسخ سپاهان به باشگاه استقلال منفی بوده و گفته است به این بازیکنان برای حضور شایسته در دور برگشت بازی‌ها نیاز دارد.

به تازگی کمیته وضعیت در پی شکایت محمد دانشگر از استقلال به سود این بازیکن رای داده است و باشگاه استقلال را به پرداخت مطالبات این بازیکن محکوم کرده است.

باشگاه استقلال دوست داشت محمد دانشگر طی تفاهم با باشگاه استقلال به مشکلات مالی خود رسیدگی می‌کرد و حالا با شکایتی که او از تیم داشته، خبر رسیده که از لیست خرید تیم خارج شده است.