پس از جدایی محمد رویانیان و انتخاب علی پروین به عنوان مدیرعامل موقت باشگاه پرسپولیس، رابطه او با علی دایی سرمربی وقت قرمزپوشان پایتخت خوب نبود و کار حتی به اعتصاب بازیکنان پرسپولیس هم کشیده شد.
علی دایی در حرفهایی که سیزدهم اسفند سال ۹۲ بازتاب وسیعی داشت و تیتر اول خبرورزشی هم شد، صراحتا تاکید کرد پرسپولیس برای حل مشکلات خودش به افکار جدید مدیریتی احتیاج دارد و تا وقتی چنین اتفاقی رخ ندهد، خبری از موفقیت نخواهد بود. در نهایت علی پروین بهار سال ۹۳ مدیریت باشگاه پرسپولیس را واگذار کرد.