بدون تردید هواداران استقلال که بازیهای این تیم در دهه ۶۰ را به خاطر دارند، جعفر مختاریفر را فراموش نکرده‌اند. جعفر آقا ۱۰ شهریور ۱۳۹۸ مصاحبه بسیار تلخی با خبرورزشی کرد که بد نیست به خلاصه حرف‌هایش دوباره نگاه کنیم:
- با برد استقلال شاد می‌شوم و کیف میکنم ولی باید بپذیریم که استقلال در لیگ نوزدهم هم قهرمان نمی‌شود (این اتفاق دقیقا رخ داد).
- بگذارید با صراحت بگویم جعفر مختاریفر الان نه خانه دارد نه خانواده و نه درآمد. در منزل یکی از دوستانم زندگی میکنم و گاهی اوقات هم خواهرم لطف می‌کند و سراغی از من می‌گیرد. از کسی انتظاری ندارم اما آیا باشگاه استقلال و وزارت ورزش نباید از من که سالها بازیکن استقلال و البته تیم ملی بودم، سراغی بگیرد؟ چون قاعده بازی را بلد نیستم به بازی گرفته نمی‌شوم.
- سال ۶۸ با تیم ملی به جام صلح و دوستی رفتیم و آقای پروین تازه سرمربی این تیم شده بود. در بازی با گینه مصدوم شدم و یک‌سال دور ماندم، پروین همان‌جا گفت فوتبال جعفر تمام شد! این حرفش خیلی ناراحتم کرد چون برگشتم و با استقلال قهرمان و نایب قهرمان آسیا شدم. البته از مرحوم منصور پورحیدری هم دلخورم ولی حالا دیگر دستش از دنیا کوتاه است.
- سال ۷۱ در اواخر بهار من را رسما از استقلال بیرون کردند به همین خاطر به سایپا رفتم تا ثابت کنم هنوز تمام نشده‌ام. بهمن ماه همان سال با سایپا چهار بر یک استقلال را بردیم و من دو پاس گل دادم. بازی مقابل استقلال تلخ بود ولی باید ثابت میکردم که هنوز تمام نشده‌ام.
- یک بار داخل ساختمان باشگاه استقلال رفتم اما من را نشناختند. الان هم بعید می‌دانم اگر مدیران این باشگاه من را ببینند بشناسند.
- گفتن این حرف خیلی تلخ است ولی استقلال دیگر قهرمان آسیا نمی‌شود چون تیم‌های ایرانی از گردونه عقب مانده‌اند.
- شهریور سال ۶۷ در دربی به پرسپولیس گل زدم ولی خاطره بدی برایم به جا ماند چون سه نفر از هواداران عزیز پرسپولیس به خاطر این گل سکته کردند و متاسفانه یکی از آن‌ها فوت کرد.
- اوایل دهه ۷۰ ازدواج کردم اما همسرم ۳۲میلیون تومان پول من را که در آن زمان خیلی زیاد بود، برداشت و رفت.
