دایی که اواخر خرداد سال ۱۳۹۲ دوباره به پرسپولیس برگشت و هدایت این تیم را بر عهده گرفت، ۲۹ مهر همان سال طی گفت‌وگویی از دوره همکاری خود با بابک زنجانی در مجموعه راه‌آهن به نیکی یاد کرد (بابک زنجانی در آن مقطع مالک هلدینگی بود که باشگاه راه‌آهن هم زیر نظر آن فعالیت می‌کرد).
دایی گفت: بابک زنجانی انسانی است که با هیچ‌کس قابل مقایسه نیست. من در مجموعه راه آهن دو فصل با ایشان همکاری کردم و همیشه از او به نیکی یاد می‌کنم.
علی دایی همچنین در بخش دیگری از مصاحبه جنجالی ۲۹ مهر خود با اشاره به شعارهایی که در جریان بازی استقلال با نفت تهران علیه او داده شد، تصریح کرد: برای استقلال و هواداران واقعی این تیم احترام قائلم اما احساس می‌کنم ماجراهای دیگری در جریان بازی استقلال- نفت به وقوع پیوست. به نظرم برخی افراد به هواداران استقلال خط داده بودند تا علیه من شعار بدهند.
این ادعای شهریار موجب شد معاون حقوقی وقت باشگاه استقلال با صراحت مدعی شود اگر دایی نتواند حرفش را ثابت کند، از او شکایت خواهند کرد.
توضیح خبرورزشی: علی دایی از اوایل تابستان سال ۱۳۹۰ تا اواخر بهار ۱۳۹۲ سرمربی راه آهن بود و همکاری‌اش با بابک زنجانی به آن دوران بازمی‌گردد.
بیشتر بخوانید: عابدزاده: اگر من بودم پرسپولیس نمی‌باخت/ زانوهایم دیگر درست نمی‌شوند