رقابتهای جام حذفی فصل ۹۰- ۹۱ به گونهای برگزار شد که پاییز سال ۹۰ استارت خورد و در روزهای پایانی زمستان همانسال با قهرمانی استقلال تهران پروندهاش بسته شد.
استقلال که در تابستان سال ۹۰ با هدایت پرویز مظلومی تیم پرستارهای بسته بود، ۲۵ اسفند ۱۳۹۰ توانست کاپ قهرمانی رقابتهای جام حذفی را کسب کند. این تیم که برای رسیدن به فینال حتی پرسپولیس را هم در دیداری پُرفرازونشیب با نتیجه ۳ بر صفر شکست داده بود، بیستوپنجم اسفند ماه سال ۹۰ شاهین بوشهر را در استادیوم حافظیه شیراز شکست داد تا قهرمان جام حذفی شود و پرویز مظلومی به اولین و تا به امروز آخرین جام خود تحت عنوان سرمربی استقلال دست پیدا کند (البته مظلومی به عنوان بازیکن و مربی جامهای متعدد و معتبری در استقلال کسب کرده است).
جدال استقلال و شاهین بوشهر در شیراز پس از پایان وقتهای قانونی و اضافی با مساوی بدون گل تمام شد ولی استقلالیها در ضربات پنالتی موفق به شکست حریف جنوبی خود شدند.
نکته مهم اینکه با وجود فتح جام حذفی، پرویز مظلومی خرداد ماه سال ۱۳۹۱ از استقلال رفت و امیر قلعهنویی جانشین او شد چون مدیران وقت باشگاه تاکید داشتند این تیم با وجود ستارگانی که در اختیار داشت، چندان موفق عمل نکرد و نتوانست قهرمان لیگ یازدهم شود.
بیشتر بخوانید: پرواز تیم ملی به فرانسه/ فدراسیون فوتبال: در تهران زمین تمرین خوب نداریم