در زمان مدیرعاملی مهدی رسول پناه در باشگاه پرسپولیس اختلافاتی بین او و یحیی گل محمدی سرمربی این تیم به وجود آمد که درنهایت باعث جدایی رسول‌پناه از مدیرعاملی پرسپولیس بود. در اواخر دوران حضور رسول‌پناه در باشگاه پرسپولیس ویدئویی از او در بین چند هوادار منتشر شد که این صحبت‌ها چالش زیادی به راه انداخت. در این ویدئو رسول‌پناه صحبت‌هایی در خصوص برخی افراد شاغل در پرسپولیس انجام داد که مدت‌ها سوژه رسانه‌ها بود.
به دنبال این موضوع حمید مشهدی یکی از ایجنت‌های فعال در فوتبال ایران از مهدی رسول‌پناه شکایت کرد که این شکایت در نهایت با رای دادگاه به سود رسول‌پناه به پایان رسید. در پی این موضوع این مدیر برنامه اعتراض خود را به دادگاه تجدیدنظر برد که در نهایت دادگاه تجدیدنظر هم با تایید رای دادگاه حکم به تبرئه و منع تعقیب مدیرعامل اسبق پرسپولیس داد تا این پرونده در نهایت مختومه شود.
مهدی رسول‌پناه در نهایت در پاییز سال ۱۳۹۹ از مدیرعاملی پرسپولیس کنار رفت تا جعفر سمیعی به جای او روی صندلی مدیرعاملی این باشگاه بنشیند.
