مرتضی پورعلی‌گنجی به دلیل مصدومیت در بازی تیم ملی فوتبال ایران مقابل قطر رباط صلیبی زانوی پای خود را جراحی کرد تا حداقل ۶ ماه نتواند پا به توپ شود.
پایان زودهنگام فصل جاری فوتبالی برای او نه تنها حضورش در جام ملت‌های آسیا را لغو کرد بلکه دیگر نمی‌تواند با پیراهن پرسپولیس در بیست و سومین دوره لیگ برتر و فصل جاری لیگ قهرمانان آسیا بازی کند.
باشگاه پرسپولیس برای استفاده از شرایط پزشکی بازیکنانی که در بازی‌های ملی دچار مصدومیت می‌شوند قصد دارد درخواست دریافت غرامت از فیفا کند. از این رو جزئیات مدارک مربوط به آسیب دیدگی این بازیکن با هماهنگی کادر پزشکی تیم ملی و فدراسیون فوتبال در حال تکمیل شدن است تا برای فیفا ارسال شود.
باشگاه پرسپولیس قصد درخواست دریافت کل مبلغ قرارداد این فصل پورعلی گنجی به همراه زیان‌های ناشی از مصدومیت او را دریافت کند تا مورد بررسی فدراسیون جهانی فوتبال قرار بگیرد.
