پس از شکست سنگین پرسپولیس مقابل استقلال در دربی مرداد ماه ۱۳۷۴ که با نتیجه ۳ بر یک رقم خورد، اعتراض هواداران پرسپولیس نسبت به یورگن گده سرمربی آلمانی این تیم اوج گرفت.
این اعتراضات کار را به جایی رساند که امیر عابدینی مدیرعامل وقت باشگاه پرسپولیس تصمیم به برکناری گده گرفت و ۳۰ مرداد ۱۳۷۴ اعلام شد این مرد آلمانی می‌رود و به جای او استانکو پابلوکوویچ سرمربی اسبق تیم ملی فوتبال کشورمان دوباره به تهران می‌آید تا هدایت سرخ‌پوشان پایتخت را بر عهده بگیرد.
استانکو آمد و پرسپولیس را از یک مجموعه متزلزل به تیمی مقتدر تبدیل کرد که حاصل آن دو قهرمانی متوالی در لیگ آزادگان و کسب عنوان سومی جام باشگاه‌های آسیا بود. استانکو همچنین پاییز سال ۱۳۷۵ توانست طلسم ۷ سال پیروز نشدن پرسپولیس مقابل استقلال را نیز بشکند و آبی‌ها را با یک گل شکست بدهد.
این مربی زمستان سال ۱۳۹۷ چشم از جهان فرو بست.