بعد از اتفاقاتی که در خاتمه جدال پرسپولیس مقابل استقلال خوزستان به وقوع پیوست، برخی از مدیران باشگاه پرسپولیس به کمیته اخلاق احضار شدند و جنگ رسانه ای میان این باشگاه و استقلال به اوج خود رسید.
در چنین شرایطی اما کریم باقری یکی از اعضای کادر فنی پرسپولیس با وجودیکه کوچک‌ترین تقصیری در اتفاق تلخ عصر جمعه نداشت، حرکت قشنگی کرد و با صراحت گفت از پیشکسوتان و هواداران استقلال عذرخواهی می‌کند. رفتاری که بازتاب مثبتی در جامعه داشت و با استقبال فراوان ستقلالی‌ها نیز همراه گردید. البته نکته مهم اینجاست که آقا کریم دوشنبه شب حرکت قشنگ خود را به معنای واقعی کلمه در یک محفل خصوصی تکمیل کرد.
شامگاه دوشنبه کریم باقری همراه با حمید استیلی و علی دایی در یک دورهمی رسمی حضور داشتند و نصرالله عبداللهی سرمربی اسبق استقلال نیز همراه با بهتاش فریبا، یار غار خود و مدیر فنی اسبق آبی پوشان پایتخت به همان مراسم دعوت بودند. حضور عمو نصی و آقا بهتاش در جمع مذکور با برخورد گرم میزبان و تمام مدعوین از جمله علی دایی همراه شد اما کریم باقری برای دو پیشکسوت استقلال که سابقه حضور در جام جهانی ۱۹۷۸ آرژانتین را نیز دارند، سنگ تمام گذاشت و بلافاصله پس از دیدن عبداللهی و فریبا خطاب به آنها گفت:
آقا! من مصاحبه کردم و بابت اتفاقات روز جمعه عذر خواستم اما همین جا از شما دو پیشکسوت ارجمند استقلالی هم به خاطر این اتفاق معذرت خواهی می‌کنم.
رفتار ارزنده کریم باقری با واکنش مثبت پیشکسوتان استقلال همراه شد و هر دو نفر به مربی پرسپولیس تاکید کردند نه تنها او را در این اتفاق مقصر نمی‌دانند بلکه رفتارش در عذرخواهی و دلجویی از استقلالی‌ها را ناشی از بزرگ منشی و اعتبارش تلقی می‌کنند. اعتباری که موجب شده کریم باقری شخصیتی ممتاز در فوتبال ایران پیدا کند.
بیشتر بخوانید: مدیر استقلال: معذرت‌خواهی از ما وظیفه کریم باقری نبود/ اگر باشگاه پرسپولیس عذر خواهی می‌کرد، جنجال راه نمی‌افتاد