کنفدراسیون فوتبال آسیا با ارسال نامه‌ای به باشگاه‌های حاضر در لیگ قهرمانان ۲۰۲۱، زمان و نحوه قرعه‌کشی مراحل بعدی این مسابقات را توضیح داد.
در مرحله یک‌هشتم نهایی، هشت تیم در غرب آسیا و هشت تیم در شرق به مصاف هم می‌روند و در نهایت چهار تیم به مرحله بعدی می‌رسند. برای مرحله بعدی، تیمها باید به قید قرعه به مصاف حریف آینده خود بروند. تاریخ قرعه‌کشی روز ۱۷ سپتامبر (۲۶ شهریور) از ساعت ۱۵ به وقت محلی (۱۲:۳۰ به وقت ایران) اعلام شده است.
همچنین این مراسم به خاطر جلوگیری از شیوع ویروس کرونا، به صورت مجازی برگزار می‌شود اما محل برگزاری در شهر کوالالامپور کشور مالزی است. در نامه بعدی برای باشگاه‌های شرکت کننده، لینک ورود به صفحه برگزاری مجازی این مراسم ارسال می‌شود.
در این فصل نیز، تیم‌های شرق و غرب آسیا تا مرحله فینال با یکدیگر مواجه نمی‌شوند. فینال به صورت تک بازی و در قسمت غرب آسیا برگزار خواهد شد.
پرسپولیس در مرحله یک‌هشتم نهایی، روز ۲۳ شهریورماه در شهر دوشنبه به مصاف استقلال تاجیکستان می‌رود و برنده این دیدار، روز ۲۶ شهریورماه، از طریق قرعه‌کشی با حریف بعدی خود آشنا می‌شود.
