تیم استقلال فصل بیستم لیگ برتر را با هدایت محمود فکری در شرایطی آغاز کرد که این مربی استقلالی با فسخ قراردادش از نساجی مازندران جدا شده و با به جان خریدن جریمه یک و نیم میلیارد تومانی هدایت استقلالی را در دست گرفت که یارگیری آن توسط احمد سعادتمند انجام شده بود.
با این همه محمود فکری بارها اعلام کرد که با افتخار این کار را انجام داده و به خاطر استقلال همه ضرر و زیان ناشی از جدایی از نساجی را به جان می‌خرد. محمود فکری در ۱۶ بازی که سرمربی استقلال بود ۶ برد کسب کرد. ۶ بار تن به تساوی داد و سه بار نیز مزه باخت را همراه با استقلال چشید. استقلال در نیم فصل اول ۲۱ گل زد و ۷ گل خورد تا در نهایت با ۲۷ امتیاز به کار خود تا روزی که فکری سرمربی این تیم بود پایان بدهد. محمود فکری که از اواخر نیم فصل اول به شدت مورد انتقاد هواداران قرار داشت پس از تساوی در اولین هفته دور برگشت مقابل مس رفسنجان (بازی که ۱-۱ شد) قید حضور در کادر فنی استقلال را زد و از این تیم جدا شد تا بلافاصله فرهاد مجیدی جای او را بگیرد.
اما فرهاد مجیدی که تنها ۱۴ بازی (از هفته دوم دور برگشت) هدایت استقلال در لیگ برتر را در دست داشت توانست سه امتیاز هم بیشتر از محمود فکری که ۱۶ بازی سرمربی این تیم بود کسب کند. استقلالِ فرهاد مجیدی در ۱۴ بازی ۹ برد، ۳ مساوی و ۳ شکست به دست آورد تا با ۱۹ گل زده و ۸ گل خورده با ۳۰ امتیاز نتیجه ای بهتر از استقلال محمود فکری با دو بازی بیشتر بگیرد. استقلال با این مربی در لیگ قهرمانان هم از گروه مرگ به عنوان صدرنشین به دور یک هشتم نهایی صعود کرد و در جام حذفی هم پس از غلبه بر پیکان و ذوب آهن در دربی یک چهارم نهایی پرسپولیس را حذف و در نهایت به دیدار نیمه نهایی رسید.
