او به عنوان بازیکن قرضی به تیم استقلال پیوست و قرار بود باشگاه ایرانی برای در اختیار گرفتن محمد محبی تا پایان فصل ۲۳۰ هزار یورو به حساب باشگاه سانتاکلارا واریز کند اما بعد از مدتی باشگاه سانتاکلارا اعلام کرد تنها ۹۰ هزار یورو را دریافت کرده است و اگر بقیه این پول را دریافت نکند، در پنجره زمستانی بازیکن ایرانی‌اش را به پرتغال فراخواهد خواند.
با پیگیری‌های بعمل آمده از سوی باشگاه استقلال و شخص علی فتح‌الله‌زاده مابقی این پول به حساب باشگاه سانتاکلارا واریز شده و محمد محبی مشکلی برای همراهی تیم آبی در ادامه بازی‌ها نخواهد داشت.
