مصطفی آجورلو به هیچ عنوان نمی‌خواهد خاطرات تلخی که طی سالیان گذشته در رابطه با آکادمی استقلال برای هواداران این تیم باقی مانده و هنوز هم هر از گاهی بخش‌های ناگفته‌ای از آنها افشا می‌شود، طی دوران مدیریت او دوباره تکرار شود و به همین خاطر قوانین بسیار سفت و سختی را برای اداره تیم‌های پایه مدنظر قرار داده است.

مدیران باشگاه می‌گویند تمام مربیان و افرادی که در بخش‌های مرتبط با آکادمی استقلال مشغول به فعالیت هستند، به طور دقیق و جدی توجیه شده‌اند اجازه کوچکترین تخلفی در آنجا ندارند و به محض اینکه باشگاه متوجه یک رفتار غیر اخلاقی یا رشوه گرفتن شود، با فرد خاطی برخورد جدی می‌کند و حتی اگر لازم باشد این افراد را به مراجع قانونی نیز معرفی خواهد کرد تا تاوان سوء‌استفاده از مقام خود و خدشه وارد کردن به اعتبار استقلال را بدهند. متأسفانه در این رابطه طی چند سال گذشته حرف و حدیث‌های زیادی پیرامون آن در آکادمی استقلال مطرح شد که اصلاً در حد اعتبار این باشگاه بزرگ نیست.